这时对于阮元而言，或许唯一的幸事，就是两江总督之位因铁保被革职出现了空缺，嘉庆一时没有合适人选，便临时让阿林保做了两江总督，而改任陕西巡抚方维甸为闽浙总督，阮元一向清楚，方维甸为人清廉能干，对海盗也曾力持主剿之议，有了他坐镇福州，对蔡牵的最后一战，胜算自又多了两成。只是福建方面，如果实行分船隔攻战术，能否配合得当尚有疑虑，是以阮元也联系了张师诚，希望八月之初，张师诚可以到台州一次，自己将与他合议围剿蔡牵之计。</p>

但与此同时，嘉庆要求查办漕帮的上谕，也已经到了杭州，阮元便也向嘉白帮问过了偷漏换米诸事，很快嘉白帮有了回复，帮内规矩从来严明，并无水手胆敢盗卖米粮，每次浙江漕帮起运漕粮，也都能妥速完成运粮之事。阮元想着余得水毕竟和自己也有多年交情，应该不会骗自己，便依嘉白帮所言，对嘉庆上了折子，同时到达圆明园的，还有这一年浙江依例上报粮价的奏折。</p>

可面对阮元这样两封奏折，嘉庆却根本不能满意。</p>

“这浙江米价，为何今年还是居高不下？朕记得，去年浙江报了水灾，朕也蠲免了几个县的赋税，有灾荒，米价高些倒也罢了。可今年呢，浙江并无报灾之事，为何米价还不能降下来？！想来也不过是海寇依然肆虐，沿海奸民为求私利，偷漏米粮给了海寇，这才让浙江米价居高不下！阮元这次浙江巡抚，是怎么当的？粮价降不下来，海防不能断绝接济，如此昏聩糊涂，朕要你继续做浙江巡抚有何用？！”</p>

“浙江漕帮并无偷漏米粮之事，阮元到底有没有严查下去？若是每个督抚都像阮元这般，都给朕报漕帮无事，那少了的漕粮是去了哪里，京仓又怎么会出现那么多朽米霉米？阮元究竟在做什么，刘凤诰之事，陆言说早已民怨沸腾，他竟报了个本未得有实据，现在托津的折子到了，刘凤诰有连号之罪！这样想来，阮元说的未有实据云云，不过是他包庇的借口！刘凤诰是己酉科进士，阮元也是，己酉科……”</p>

“今年这几件案子，哪个没有他们己酉科的影子？李毓昌案，铁保是己酉科副主考，阮元刘凤诰，皆以恩师称之，黑档案，李钧简是己酉科，杭州科场案，刘凤诰任泽和，一样是己酉科！嘿嘿，真是好老师，好学生啊，有这般昏庸包庇的老师，也就有这般上下欺瞒的学生！平日空言师生情谊，实则蝇营狗苟，无恶不作！朕亲政十年，对这些人太客气了，这一次，朕若是不出重拳，这天下百姓，还如何相信我大清的国法纲常！”</p>

就这样，阮元的命运，也开始逐渐发生了变化。</p>

嘉庆十四年七月初，新的上谕到了杭州，这次嘉庆对阮元再未容情，而是直接命令阮元停止一切浙江巡抚职务，将浙江政事交予布政使庆格、按察使蒋继勋共同办理。同时，嘉庆让江苏布政使蒋攸铦南下杭州，待蒋攸铦到任之后，阮元便需将浙江巡抚印信交割于他。之后，阮元须入京觐见，等候嘉庆发落。</p>

上谕下达之前，托津和卢荫溥也已在杭州将刘凤诰一案前后文卷整理完毕，便即押着刘凤诰，一道回了京城。阮元接了上谕，清楚这时自己根本无法对嘉庆申辩，而且自己也确有识人之过，只得会同庆格、蒋继勋，以及杭嘉湖道李赓芸，将未决之事一一交接给了三人。之后，阮元回归抚院内宅，闭门不出，只等新任巡抚到杭州接印，便即启程，北上向嘉庆谢罪。</p>